De grootste permanent toegankelijke verzameling van na-oorlogse, Nederlandse beeldende kunst is niet te vinden in het Stedelijk Museum Amsterdam, maar in het AMC. De meeste van de kunstwerken hangen in de openbare ruimten van het AMC. Deze werken zijn zoveel mogelijk gegroepeerd naar stijl of stroming.
Collectie
Het streven van de grondleggers was gericht op een verzameling die de verschillende stromingen in de na-oorlogse Nederlandse schilderkunst zou weerspiegelen. In de loop der jaren kon de collectie worden aangevuld met tal van schenkingen, werken in langdurig bruikleen en aankopen.
De vroegste AMC-verzamelaars legden het zwaartepunt bij Nederlandse schilderkunst uit de jaren vijftig, zestig en zeventig. Ruim vertegenwoordigd zijn de perioden van Cobra, Materiekunst, Nulkunst en Nieuwe Figuratie, met namen als Karel Appel, Jaap Wagemaker, Armando en Reinier Lucassen. Het afgelopen decennium is de collectie uitgebreid met werken van Marlène Dumas, Marc Mulders, René Daniëls en tal van andere hedendaagse schilders, maar vooral ook met veel fotografisch werk.
De AMC-afdeling Kunstzaken is verantwoordelijk voor beheer en uitbreiding van de collectie.
Beeldende kunst
Het AMC biedt onderdak aan de grootste permanent geëxposeerde collectie Nederlandse beeldende kunst van na 1945. De basis daarvoor werd gelegd ten tijde van de bouw in het begin van de jaren tachtig, toen de zogenoemde één-procentsregeling een serie weloverwogen aankopen mogelijk maakte.
Exposities
Naast de vaste collectie beschikt het AMC over twee expositieruimtes: de Brummelkamp Galerie en de Vitrines. Kunstzaken organiseert hier iedere twee maanden wisselende tentoonstellingen.
Kunstboek
In November 2003 verscheen het AMC Kunstboek. Voor dit boek werd een keuze van ruim honderd werken uit de AMC-kunstcollectie gemaakt, om een impressie te geven van wat er in de afgelopen decennia is verzameld.
Kunstopdrachten
Ieder jaar wordt in het kader van de jaarlijkse medische publiekslezing De Anatomische Les een opdracht gegeven aan een kunstenaar om een prent te vervaardigen in een beperkte oplage met als onderwerp 'De menselijke gedaante'. Jaarlijks wordt er een kunstenaar gevraagd om een foto voor de AMC-kerstkaart te maken. Lees hier meer over de kunstopdrachten. 
