Sinds 1 januari 2017 is het wetenschappelijk onderzoek ondergebracht in acht gezamenlijke onderzoeksinstituten Amsterdam UMC locatie AMC en VUmc. Deze instituten zijn:
Hersenen
Amsterdam NeuroscienceMaag-darmstelsel en stofwisseling
Amsterdam Gastroenterology Endocrinology Metabolism (AGEM)Kanker
Cancer Center AmsterdamVoortplanting en ontwikkeling
Amsterdam Reproduction & DevelopmentAfweer en infectieziekten
Amsterdam Infection & lmmunityPublieke gezondsheidszorg
Amsterdam Public HealthHart- en vaatziekten
Amsterdam Cardiovascular SciencesBewegen
Amsterdam Movement Sciences