- Dijk Frederike, Bergen Arthur A. B., Kamphuis Willem GAP-43 expression is upregulated in retinal ganglion cells after ischemia/reperfusion-induced damage Experimental eye research 2007;84 (5):858-867 [PubMed]
- Kamphuis W., Dijk F., van Soest S., Bergen A. A. B. Global gene expression profiling of ischemic preconditioning in the rat retina Molecular vision 2007;13:1020-1030 [PubMed]
- Kamphuis Willem, Dijk Frederike, Bergen Arthur A. B. Ischemic preconditioning alters the pattern of gene expression changes in response to full retinal ischemia Molecular vision 2007;13:1892-1901 [PubMed]
- Kamphuis Willem, Dijk Frederike, Kraan Willem, Bergen Arthur A. B. Transfer of lens-specific transcripts to retinal RNA samples may underlie observed changes in crystallin-gene transcript levels after ischemia Molecular vision 2007;13:220-228 [PubMed]
- Kamphuis Willem, Cailotto Cathy, Dijk Frederike, Bergen Arthur, Buijs Ruud M. Circadian expression of clock genes and clock-controlled genes in the rat retina Biochemical and biophysical research communications 2005;330 (1):18-26 [PubMed]
Curriculum Vitae
________________________________________
Personalia
Naam Frederike Dijk
Functie Post-doc onderzoeker
Geboren 5 juni 1973 te Utrecht
Profiel
Post-doc onderzoeker gespecialiseerd in moleculaire oncogenetica
Werkadres
Academisch Medisch Centrum (AMC)
Afdeling Pathologie – Oncologie
Kamer L2-114
Meibergdreef 9
1105 AZ Amsterdam
T: 020-5665709
E-mail: f.dijk@amc.uva.nl
Thuisadres
Bos en Lommerweg 9-III
1055 DK Amsterdam
T: 020-4864789 / 06-422 08 164
E-mail: frederike.dijk@gmail.com
Werkervaring
________________________________________
Mei 2009 - heden
Samenvatting
Post-doc project, Academisch Medisch Centrum (AMC, Amsterdam)
Afdeling Pathologie - Oncologie
Prof. Dr. M.J. van de Vijver
Het opzetten van klinisch georienteerde onderzoekslijnen voor verschillende types solide tumoren: borst, ovarium, pancreas en oesophaguskanker.
April 2006 - april 2009
Samenvatting
Lezingen, congressen
Posterpresentatie
Voortgangsvergaderingen
Post-doc project, Vrije Universiteit Medisch Centrum (VUmc)
Afdeling Keel-, neus- en oorheelkunde - Tumorbiologie
Prof. Dr. R.H. Brakenhoff
Ophelderen of een afstandsmetastase voorspeld kan worden op basis van het genetisch en/of expressie-profiel van primaire hoofd-halsplaveiselcelcarcinomen .
Voor het transriptoomprofiel is vers-ingevroren materiaal gehybridiseerd op Agilent 4x44K Agilent arrays, voor het genetisch profiel is het Illumina 6K GoldenGate SNP-platform succesvol geëvalueerd op archivaal DNA. Voor de data analyse (o.a. R-scripten) is samengewerkt met verscheidene bio-informatici.
211e KNO-vergadering (Nieuwegein), Marie Curie genome architecture in relation to disease (MC GARD - Amsterdam), International Academy of Oral Oncology (IAOO - Amsterdam), Micro-array cursus (Hogeschool Leiden)
6th international symposium on Minimal residual cancer (ISMRD - Hamburg)
Graz (Oostenrijk), Montpellier (Frankrijk), Oslo (Noorwegen), Amsterdam en Leiden
Juni 2004 - maart 2006
Samenvatting
Poster-presentatie
Geïnviteerde lezing
Post-doc project, Nederlands Instituut voor Neurowetenschappen (NIN)
Afdeling Moleculaire Ophthalmogenetica
Prof. Dr. A.A.B. Bergen
Het endogeen regeneratief vermogen van de retina is onderzocht d.m.v ischemische pre-conditionering. De plasticiteit van het post-ischemische retinale netwerk is onderzocht m.b.v. immuuncytochemie (ICC), real time quantitative PCR (RT qPCR) en Agilent 20K micro-arrays door aan te tonen welke celpopulaties nieuwe uitlopers en contacten maken.
ARVO (Association for Research in Vision and Ophthalmology, Ft. Lauderdale, VS)
Merck-Sharp & Dome, Amsterdam
Aug 1999- juni 2004
Samenvatting
Posterpresentaties
Bezoeken Promotieonderzoek, NIN / Universiteit van Amsterdam - UvA
Faculteit der Natuurwetenschappen, Wiskunde en Informatica
Promotor Prof. Dr. F.H. Lopes da Silva, co-promotor Dr. W. Kamphuis
Het ischemie/reperfusiemodel is opgezet als diermodel (rat) voor glaucoom. Hiermee is gevonden dat de post-ischemische retinale neurodegeneratie ten dele het gevolg is van de activering van AMPA-type glutamaat receptoren. Daarnaast is in kaart gebracht welke celtypes verloren gaan en van welke herstel optreedt op genexpressie niveau en/of eiwitniveau (ICC, RT qPCR).
ARVO 2001, 2002 en Endo-Neuro-Psycho Meeting (Doorwerth)
Prof. Dr. N.N. Osborne (Nuffield Ophthalmology Lab, Oxford, V.K.) en
Dr. J.H. Brandstätter (Max Planck Institut für Hirnforschung, Frankfurt, Duitsland).
Opleidingen
________________________________________
Aug 1999 - mei 2004
Cursussen Onderwijsprogramma van de ONWA
(Onderzoeksschool Neurowetenschappen Amsterdam)
o.a. Neurowetenschappen voor gevorderden, Proefdierkunde (Art.9), Moderne elektrofysiologische technieken, Moleculaire neurobiologie, Neuropsychofarmacologie en Introductie tot bioinformatica
Aug 1994 – juni 1999
Feb 1999 - maart 1999
Okt 1997 - april 1998
Okt 1996 - april 1997 Medische Biologie, specialisatie Neurobiologie
Universiteit van Amsterdam, Faculteit der Biologie
Scriptie - Prof. Dr. F. Lopes da Silva, Experimentele Dierkunde, UvA, Amsterdam: ‘Mechanisms of selective visual attention’
Stage Antropogenetica - Prof. Dr. R. Frants, Sylvius Laboratorium, Leiden: ‘Identification of new candidate genes for fascio-scapulo humeral muscular dystrofia’
Stage Neuroanatomie - Dr. C. van Eeden, NIN (voormalig Nederlands Instituut voor Hersenonderzoek), Amsterdam: ‘Direct and indirect connections between the prefrontal cortex and the ventral tegmental area’
1993 - 1994 Spaanse taal- en letterkunde
Universiteit van Amsterdam, Faculteit der Letteren
1992 - 1993 Reis door Azië
1984 - 1992 HAVO, Athaeneum B - Theresia Lyceum, Tilburg
Overig
________________________________________
Talen Nederlands en Engels uitstekend
Frans en Duits redelijk tot goed
Software Microsoft Office Word, Excel, PowerPoint, Access, Adobe Photoshop, R
Publicatielijst
________________________________________
1. Kamphuis W, Dijk F, Bergen AAB. Ischemic preconditioning alters the pattern of gene expression changes in response to full retinal ischemia. Molecular Vision 2007;13:1892-1901.
2. Kamphuis W, Dijk F, Van Soest S, Bergen AAB. Global gene expression profiling of ischemic preconditioning in the rat retina. Molecular Vision 2007;13:1020-1030.
3. Dijk F, Bergen AAB, Kamphuis W. GAP-43 expression is upregulated in retinal ganglion cells after ischemia/reperfusion-induced damage. Experimental Eye Research 2007;84:858-867.
4. Kamphuis W, Dijk F, Kraan W, Bergen AAB. Transfer of lens-specific transcripts to retinal RNA samples may underlie observed changes in crystallin-gene transcript levels after ischemia. Molecular Vision 2007;13:220-228.
5. Kamphuis W, Cailotto C, Dijk F, Bergen A, Buijs RM. Circadian expression of clock genes and clock-controlled genes in the rat retina. Biochemical and Biophysical Research Communications 2005;330:18-26.
6. Dijk F, van Leeuwen S, Kamphuis W. Differential effects of ischemia/reperfusion on amacrine cell subtype-specific transcript levels in the rat retina. Brain Research 2004;1026:194-204.
7. Dijk F, Kamphuis W. An immunocytochemical study on specific amacrine cell subpopulations in the rat retina after ischemia. Brain Research 2004;1026:205-217.
8. Dijk F, Kamphuis W. Ischemia-induced alterations of AMPA-type glutamate receptor subunit. Expression patterns in the rat retina - an immunocytochemical study. Brain Research 2004;997:207-221.
9. Dijk F, Kraal-Muller E, Kamphuis W. Ischemia-induced changes of AMPA-type glutamate receptor subunit expression pattern in the rat retina: A real-time quantitative PCR study. Investigative Ophthalmology & Visual Science 2004;45:330-341.
10. Kamphuis W, Dijk F, O'Brien BJ. Gene expression of AMPA-type glutamate receptor subunits in rod-type ON bipolar cells of rat retina. European Journal of Neuroscience 2003;18:1085-1092.
11. Kamphuis W, Klooster J, Dijk F. Expression of AMPA-type glutamate receptor subunit (GluR2) in ON-bipolar neurons in the rat retina. Journal of Comparative Neurology 2003;455:172-186.
Gepubliceerde abstracts
________________________________________
1. Dijk F, Braakhuis BJM, Krugers T, Brakenhoff RH. Genome-wide screening of head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC) using single nucleotide polymorphic marker (SNP)-arrays. Cellular Oncology 2007;29:105.
2. Dijk F, Braakhuis BJM, Ariyurek Y, Krugers T, Brakenhoff RH. Genome-wide screening of head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC) using single nucleotide polymorphic marker (SNP)-arrays. Oral Oncology 2007;2:73.
3. Kamphuis W, Dijk F, Van Soest S, Bergen AAB. Microarray analysis of gene expression profiles in the rat retina after ischemia-reperfusion. Investigative Ophthalmology & Visual Science 2005;46.
4. Dijk F, Kamphuis W, Bergen AAB. Increased GAP-43 expression in the post-ischemic retina: An indication of plasticity of the inner retina. Investigative Ophthalmology & Visual Science 2005;46.
5. Dijk F, Kamphuis W. Ischemia-induced alterations in subunit composition of AMPA-type glutamate receptors in rat retina. Investigative Ophthalmology & Visual Science 2001;42:S744.
Prof. MD PhD M.J. van de Vijver (Genetic alterations and gene expression profiles of solid tumors)