Binnen het MMI vallen de vakgroepen Bacteriologie, Mycologie, Parasitologie en Virologie en de deellaboratoria zijn onderverdeeld in: Speciële Bacteriologische Technieken (SBT), Speciële Mycologische Technieken (SMT), Speciële Parasitologische Technieken (SPT), Speciële Virologische Technieken (SVT), Serologische Technieken, Moleculaire Technieken, Centrale Monster ontvangst en de Mediabereiding
