In het IOO-AMC zijn verschillende opleidingen, de afdeling Onderwijssupport, het medisch onderwijskundig onderzoek en de opleidingscommissies bijeengebracht. Er wordt tussen de opleidingen samengewerkt op gebieden als kwaliteitszorg, docentprofessionalisering, onderwijstechnologie en faciliteiten. Onderwijssupport is een stafafdeling binnen het IOO. De afdeling is opgedeeld in vijf verschillende centra.